Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms