Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gli2Q0VGT2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gli2Q0VGT2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli2Q0VGT2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms