Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam83bQ0VBM2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83bQ0VBM2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms