Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TrioQ0KL02 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms