Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms