Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb5Q02739 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms