Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh1Q02576 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms