Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms