Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms