Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EgfrQ01279 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EgfrQ01279 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms