Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmgcrQ01237 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HmgcrQ01237 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms