Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga4Q00651 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms