Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd80Q00609 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms