Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shc1P98083 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms