Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brca2P97929 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brca2P97929 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brca2P97929 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brca2P97929 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brca2P97929 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brca2P97929 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms