Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smn1P97801 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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