Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AlkP97793 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AlkP97793 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AlkP97793 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AlkP97793 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AlkP97793 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AlkP97793 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AlkP97793 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AlkP97793 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AlkP97793 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AlkP97793 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AlkP97793 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AlkP97793 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AlkP97793 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AlkP97793 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AlkP97793 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AlkP97793 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AlkP97793 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AlkP97793 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AlkP97793 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AlkP97793 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AlkP97793 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
AlkP97793 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AlkP97793 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AlkP97793 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AlkP97793 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AlkP97793 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AlkP97793 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AlkP97793 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
AlkP97793 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AlkP97793 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AlkP97793 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AlkP97793 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AlkP97793 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AlkP97793 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AlkP97793 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AlkP97793 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AlkP97793 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AlkP97793 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AlkP97793 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AlkP97793 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AlkP97793 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AlkP97793 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AlkP97793 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
AlkP97793 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AlkP97793 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AlkP97793 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AlkP97793 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AlkP97793 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
AlkP97793 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AlkP97793 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AlkP97793 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AlkP97793 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AlkP97793 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AlkP97793 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AlkP97793 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
AlkP97793 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
AlkP97793 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AlkP97793 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AlkP97793 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AlkP97793 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AlkP97793 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AlkP97793 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AlkP97793 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
AlkP97793 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
AlkP97793 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AlkP97793 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AlkP97793 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AlkP97793 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AlkP97793 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AlkP97793 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AlkP97793 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AlkP97793 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AlkP97793 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AlkP97793 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AlkP97793 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AlkP97793 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AlkP97793 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AlkP97793 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AlkP97793 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AlkP97793 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
AlkP97793 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AlkP97793 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AlkP97793 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AlkP97793 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AlkP97793 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AlkP97793 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AlkP97793 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms