Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3aP97351 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3aP97351 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3aP97351 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3aP97351 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps3aP97351 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps3aP97351 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms