Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctps1P70698 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctps1P70698 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms