Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgif1P70284 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgif1P70284 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms