Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms