Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms