Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps3P62908 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps3P62908 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps3P62908 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps3P62908 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps3P62908 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps3P62908 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps3P62908 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms