Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Depdc5P61460 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.3 ms