Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap25P60879 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap25P60879 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap25P60879 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap25P60879 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap25P60879 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap25P60879 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Snap25P60879 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snap25P60879 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap25P60879 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms