Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms