Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hps5P59438 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hps5P59438 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hps5P59438 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hps5P59438 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hps5P59438 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hps5P59438 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hps5P59438 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hps5P59438 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hps5P59438 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hps5P59438 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hps5P59438 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hps5P59438 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hps5P59438 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hps5P59438 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hps5P59438 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hps5P59438 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hps5P59438 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hps5P59438 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hps5P59438 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms