Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Senp1P59110 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Senp1P59110 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Senp1P59110 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Senp1P59110 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Senp1P59110 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Senp1P59110 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Senp1P59110 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Senp1P59110 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Senp1P59110 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Senp1P59110 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Senp1P59110 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Senp1P59110 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Senp1P59110 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Senp1P59110 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms