Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dpf3P58269 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dpf3P58269 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms