Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CtnsP57757 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtnsP57757 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtnsP57757 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtnsP57757 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms