Protein–RNA interactions for Protein: P56390

Cks2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks2P56390 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cks2P56390 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cks2P56390 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms