Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ephb3P54754 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms