Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23bP54728 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad23bP54728 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.1 ms