Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad23aP54726 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms