Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms