Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FanccP50652 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FanccP50652 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FanccP50652 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FanccP50652 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FanccP50652 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FanccP50652 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FanccP50652 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FanccP50652 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FanccP50652 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FanccP50652 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FanccP50652 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FanccP50652 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FanccP50652 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FanccP50652 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FanccP50652 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FanccP50652 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FanccP50652 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FanccP50652 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FanccP50652 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FanccP50652 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FanccP50652 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FanccP50652 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FanccP50652 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FanccP50652 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FanccP50652 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FanccP50652 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FanccP50652 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FanccP50652 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FanccP50652 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanccP50652 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanccP50652 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanccP50652 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanccP50652 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanccP50652 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanccP50652 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FanccP50652 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FanccP50652 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanccP50652 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanccP50652 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanccP50652 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanccP50652 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanccP50652 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanccP50652 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanccP50652 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FanccP50652 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FanccP50652 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FanccP50652 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FanccP50652 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FanccP50652 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FanccP50652 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FanccP50652 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FanccP50652 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FanccP50652 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FanccP50652 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FanccP50652 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FanccP50652 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FanccP50652 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms