Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnni3P48787 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms