Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca1P48754 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brca1P48754 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brca1P48754 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca1P48754 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca1P48754 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brca1P48754 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brca1P48754 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brca1P48754 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brca1P48754 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brca1P48754 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brca1P48754 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brca1P48754 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brca1P48754 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brca1P48754 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca1P48754 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca1P48754 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca1P48754 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms