Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rfx1P48377 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms