Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TgfaP48030 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TgfaP48030 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TgfaP48030 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms