Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd4P46935 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nedd4P46935 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms