Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf1P46099 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf1P46099 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms