Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NodalP43021 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NodalP43021 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NodalP43021 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NodalP43021 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NodalP43021 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NodalP43021 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NodalP43021 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NodalP43021 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NodalP43021 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NodalP43021 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NodalP43021 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NodalP43021 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NodalP43021 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NodalP43021 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NodalP43021 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NodalP43021 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NodalP43021 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NodalP43021 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NodalP43021 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NodalP43021 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NodalP43021 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NodalP43021 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NodalP43021 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NodalP43021 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NodalP43021 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NodalP43021 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NodalP43021 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NodalP43021 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NodalP43021 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NodalP43021 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms