Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd1P40201 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd1P40201 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd1P40201 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chd1P40201 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Chd1P40201 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chd1P40201 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chd1P40201 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd1P40201 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd1P40201 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd1P40201 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chd1P40201 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd1P40201 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms