Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf2P39429 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf2P39429 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf2P39429 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf2P39429 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf2P39429 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms