Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TpoP35419 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TpoP35419 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TpoP35419 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TpoP35419 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TpoP35419 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TpoP35419 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TpoP35419 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TpoP35419 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TpoP35419 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TpoP35419 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TpoP35419 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TpoP35419 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TpoP35419 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TpoP35419 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TpoP35419 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TpoP35419 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TpoP35419 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TpoP35419 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TpoP35419 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TpoP35419 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TpoP35419 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TpoP35419 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TpoP35419 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms