Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab20P35295 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms