Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IppP28575 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IppP28575 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IppP28575 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IppP28575 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IppP28575 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IppP28575 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IppP28575 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IppP28575 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IppP28575 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IppP28575 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IppP28575 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IppP28575 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IppP28575 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IppP28575 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IppP28575 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IppP28575 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IppP28575 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IppP28575 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IppP28575 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IppP28575 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IppP28575 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IppP28575 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IppP28575 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IppP28575 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IppP28575 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IppP28575 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IppP28575 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IppP28575 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IppP28575 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IppP28575 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IppP28575 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IppP28575 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IppP28575 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IppP28575 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IppP28575 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IppP28575 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IppP28575 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IppP28575 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IppP28575 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IppP28575 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IppP28575 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IppP28575 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IppP28575 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IppP28575 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IppP28575 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IppP28575 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IppP28575 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IppP28575 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IppP28575 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IppP28575 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IppP28575 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IppP28575 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IppP28575 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IppP28575 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IppP28575 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IppP28575 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IppP28575 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IppP28575 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IppP28575 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IppP28575 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IppP28575 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IppP28575 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms