Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms