Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd12P23812 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms